14 open Master projects

Here are the titles :

Team 1 – Biophysics of the brain :

1. Imaging the dissipation of Ca2+ micro domains w/ SAF BFP imaging
2. A reproducible metric for tissue clearing with quantitative phase imaging
3. quantifying EW scattering in different cell types w/ standing-wave TIRF

Contact Martin Oheim : martin.oheim [at] u-paris.fr

More to folow.

Team 2 – Cerebellar Neurophysiology :

• In vivo neuronal dynamics during adaptation to movement perturbations (keywords = Sensorimotor integration, optogenetics, in vivo neuropixel, in vivo 2-photon imaging) – Details and contact

Team 3 – Biology and physiopathology of the spinal cord :

• Study of the effects of repetitive trans-spinal magnetic stimulation on functional and tissue recovery in an experimental model of transverse myelitis in mice (keywords = spinal cord injury, non-invasive treatment, transverse myelitis, functional recovery, mouse model, remyelination, oligodendrocytess) – Details and contact
• Restoration of excitation/inhibition balance to modulate motoneuron degeneration in Amyotrophic Lateral Sclerosis (keywords = ALS, Motoneuron, Spinal cord, Electrophysiology, In vivo intracellular recordings, Gene therapy, Pharmacology) – Details and contact
• Study of early changes in structure and composition of neuromuscular junctions in different muscle fiber types during amyotrophic lateral sclerosis (keywords = neuromuscular junction, motor neuron, myofiber, MuSK/LRP4, amyotrophic lateral sclerosis) – Details and contact

Team 4 – Membrane dynamics :

• Identification and study of partners of C9orf72-SMCR8-WDR41 complex associated with amyotrophic lateral sclerosis (keywords = ALS, C9orf72, cellular biology, proteomics, lysosomes) – Details and contact

Team 6 – Synapses of Affective Behaviors :

• Regulation of affective states by bimodal GABAergic transmission in the mouse Medial Habenula (keywords = ex vivo electrophysiology, in vivo fiber photometry and optogenetics) – Details and contact

Team 7 – Molecular Biology of Neuronal Transport :

• Development of New Molecular Strategies for the Treatment of Rett Syndrome in mutant mice (keyword = Molecular Neurobiology, Neurodevelopmental Disorders, Mouse Models, Nuclear Transport, MeCP2, Importins) – Details and contact

Team 8 – Orientation and Coordination :

• Role of the Cerebellum in Motor Coordination and Learning (keywords = cerebellum, motor control, locomotion, in vivo electrophysiology, in vivo 2-photon calcium imaging, behavioral analysis) – Details and contact
• Spatial orientation signals across Thalamus and Head Direction Cortex (keywords = spatial orientation; electrophysiology; brain slices; neuromodulation; in vivo recordings) – Details and contact
• Unraveling animal behavior through decoding of non-invasive, continuous measurements (keywords = behavior, monitoring, machine-learning, decoding) – Details and contact
• Head direction and goal direction signals (keywords = electrophysiology, population analysis, attractor network, presubiculum, mouse) – Details and contact

Two open PhDs

Here are the subjects :

1. Bessel-beam TIRF
2. OASIS laser parameter optimization

More to follow.

Contact information

We are being used to read off pH from comparing dripped Lackmus paper to a colour scale. Likewise, the Suzuki method encodes keys by colour, which allows to code melodies before mastering musical notes. But did you think about encoding nanometric optical distances along the microscope’s axis into colour? We did. And this is the essence of CC-NANOSCALE, or colour-coded nanoscale, a project now funded by UPC.

Following the promising market study conducted by the agency TEMATYS and Martin Oheim’s presentation of intermediate results in front of a panel of experts, non-experts and innovators, SPPIN’s team 1 (Biophysics of the brain) was awarded a 2024-25 pre-maturation grant from Université Paris Cité (UPC). 

We are now hiring a study engineer (ingénieur d’études) (H/F/or other) starting ASAP and during 1 year. Please send applications (letter of motivation, CV and three academic references) to : nanoscale [AT] sppin.fr

The post NANOSCALE GOES COLOUR-CODED: Hiring an engineer (IE CNRS, CDD 1 year) first appeared on SPPIN - CNRS UMR 8003.

The laboratory is looking for a highly motivated scientist with experience in rodent embryo studies to study the role of lysosomal metabolite transporters in the nutrition of mouse embryos by the visceral yolk sac endodermal epithelium during development. This epithelium feeds embryos with nutrients derived from endocytosis and lysosomal degradation of maternal macromolecules before the onset of a functional placenta. In unpublished studies, we developed knock-out and knock-in mouse models and discovered a synthetic embryonic lethal interaction between lysosomal transporters that forms the basis of this project.

The laboratory, located at Université Paris Cité, Campus Saint-Germain-des-Prés, France, focuses on lysosomal membrane transporters that shape the maintenance and adaptive homeostasis of mammalian cells. We use multidisciplinary approaches.

The candidate must have expertise in mouse colony management, embryo isolation and standard cell biology techniques. An experience in biochemistry and/or epithelium culture would also be appreciated.

The position is funded for two years.

Candidates should apply through the CNRS job offer portal.

Inquiries about the position and letters of recommendation should be sent to:

Relevant references:

• Leray X et al (2021) Arginine-selective modulation of the lysosomal transporter PQLC2 through a gate-tuning mechanism, PNAS 118, e2025315118.
• Jungnickel KEJ, Guelle O, et al (2023) MFSD1 in complex with its accessory subunit GLMP functions as a general dipeptide uniporter in lysosomes. bioRxiv 2023.12.15.570541.
• Zohn IE & Sarkar AA (2010) The visceral yolk sac endoderm provides for absorption of nutrients to the embryo during neurulation (review). Birth Defects Res A Clin Mol Teratol 88:593-600.

The post Open postdoctoral Position on the role of lysosomes in mouse embryo physiology first appeared on SPPIN - CNRS UMR 8003.

L’ingénieur.e travaillera sous la direction du DU et sera affecté.e à la core-unit, équipe transversale au sein du SPPIN (CNRS UMR8003). Le/la candidat.e aura pour charge de développer, maintenir et accompagner l’utilisation d’un parc important de microscopes optiques high-end, souvent fait maison. Fort de ses compétences en optique, optomécanique et photonique, le/la candidat.e aura la capacité d’innover, d’améliorer et proposer des nouvelles réalisations optiques, en collaboration avec les équipes du SPPIN. Ceci n’est pas un poste plateforme, mais un poste ayant une forte valence recherche et technologique. Ce travail polyvalent, sera réalisé typiquement via des projets qui peuvent impliquer une ou plusieurs équipes du SPPIN et typiquement seront réalisé sous forme une collaboration avec autres ingénieur.e.s et/ou chercheurs.

Organisation

CNRS UMR 8003, SPPIN

Localisation

Université Paris Cité, Campus Saint Germain, SPPIN

Missions

L’ingénieur.e de recherche aura comme tâche les études de conception optique et opto-mécaniques nécessaires à la construction, au maintien et à la remise en état des microscopes photoniques du SPPIN (Saints Pères Paris Institute for the Neurosciences). Par suite de ces études, il/elle aura en charge la recherche des composants optimisés nécessaires au développement ou à l’augmentation des fonctionnalités de ces instruments et leur bon fonctionnement. Ce travail sera conduit au sein d’une structure opérationnelle qui inclut déjà deux équipes spécialistes ainsi qu’une composante optique/opto-mécanique au sein de l’UMS du site.

Activités

• Faire le bilan des microscopes existants et schématiser leur fonctionnement optique
• Évaluer les priorités en termes de jouvence
• Participer à la conception optique/opto-mécanique
• Rechercher les composantes optiques optimales
• Assembler les modules optiques revisités des différents microscopes
• Conduire des tests de validation/qualification
• Rédiger les rapports d’intégration et de tests, incluant les schéma optique et opto-mécaniques
• Participer à la conception et construction de nouveaux instruments
• Participer à des projets de recherche, à la collecte et analyse de données et à la rédaction de publications

Compétences

Connaissances :

• Systèmes optiques, conception optique et opto-mécanique, métrologie (connaissances approfondies)
• Instrumentation en microscopie linéaire et non-linéaire (connaissances approfondies)
• Physique des tissus (connaissances approfondies)
• Dispositifs expérimentaux (connaissances approfondies)
• Techniques de présentation écrite et orale
• Langues : Français et Anglais (parlé et écrit)

Compétences opérationnelles :

• Utiliser les logiciels spécifiques au domaine (LabVIEW, Matlab, SolidWorks, Python)
• Respecter les conditions d’utilisation des dispositifs expérimentaux
• Aptitude au travail en équipe projet
• Appliquer les procédures d’assurance qualité
• Appliquer les règles d’hygiène et de sécurité
• Assurer une veille technologique
• Les qualités humaines et la capacité d’apprentissage, également sur des domaines connexes, sont aussi des critères déterminant afin de candidater à ce poste.

Contexte

Driven by curiosity, enabled by technology: suivant ce crédo du laboratoire, nous avons au SPPIN fait le choix de concentrer des compétences clés, dont la présence est cruciale pour toutes les équipes au sein d’une équipe transversale, la core unit. Ainsi, au sein de cette équipe, nous avons regroupé les services administratives, des compétences en instrumentation scientifique, la biologie moléculaire, de culture cellulaire, de la génération des organoides cérébraux ainsi que de l’informatique (calcul scientifique, programmation, instrumentation). Nous souhaitons encore élargir cet offre par le renouvellement d’un poste d’IR en optique et neurophotonique (vacant depuis le départ de Bruno Lagarde, parti en retraite). Le poste est sensé de renforcer un axe déjà forte au laboratoire, l’optique et la photonique représenté par Martin Oheim, Marc Guillon et Ali Jalil. La/le candidat.e travaillera en bonne intelligence avec le service commun de microscopie  (Fabrice Licata) et l’atelier de prototypage au sein de l’UMS (Thierry Bastien).

Pour plus d’informations contactez Martin Oheim.

Pour postuler à cette fonction, vous devez joindre votre CV, liste de publications, références académiques et une lettre de motivation.

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